Spjutflicksländan är som mest aktiv under högsommaren, från slutet av juni till augusti, beroende på var i landet den finns. Den flyger lågt över vattnet och vilar ofta på vattenväxter eller i gräset nära strandkanten. Trots sin litenhet kan den vara ganska territoriell och hanarna ses ofta patrullera revir eller sitta vaksamt och vänta på honor. Honan är mer diskret färgad i blått, grönt eller brunt med mer dämpade teckningar. Äggläggningen sker ofta i par, där honan för in äggen i växtdelar under vattenytan medan hanen fortfarande håller henne i parningsgrepp.